11SAJIB

11° Simposio Argentino de Jóvenes Investigadores en Bioinformática, organizado por RSG Argentina.

Cuándo

29 y 30 de octubre

Modalidad

Presencial

Cronograma

Dos días: talleres el 29 de octubre y el simposio el 30, en la UNNOBA. Vamos a ir sumando las actividades a medida que se confirmen.

Franco Cuccovia Carolina Cerrudo

Análisis genómico a partir de datos de NGS

Franco Cuccovia — Becario doctoral CONICET, Universidad Nacional de Quilmes
Carolina Cerrudo — Investigadora adjunta, Universidad Nacional de Quilmes

Un taller práctico sobre el análisis de datos de secuenciación de lecturas cortas (NGS), usando Galaxy, una plataforma en la nube que no requiere instalar software ni gran capacidad de cómputo. A partir de un conjunto reducido de datos se evaluará la calidad de las lecturas y se hará el trimming, para luego ensamblar de novo explorando el efecto de distintos parámetros y evaluando el resultado con distintas herramientas. Por último, se hará la identificación taxonómica y la anotación génica del ensamblado para caracterizar el proteoma predicho, explorando dominios y posibles funciones proteicas, y se discutirán herramientas y estrategias alternativas según los objetivos del análisis.

Andrea Peñas Ballesteros Nicolás Lavatti

Explorando datos biológicos con R

Andrea Peñas Ballesteros — Lic. en Genética y Mg. en Bioinformática y Biología de Sistemas, CITNOBA-UNNOBA
Nicolás Lavatti — Lic. en Genética, UNNOBA / Trebe Biotech

Una introducción a la programación en R y su aplicación al análisis y visualización de datos biológicos. Se recorrerán conceptos básicos como variables, tipos de datos, funciones y manejo de errores, para luego explorar y visualizar datos con ggplot2, incorporando buenas prácticas de diseño gráfico y estadístico y analizando errores y trampas visuales frecuentes en la comunicación de resultados.

Matías Mac Allister Diego Peralta

Introducción a la genómica de poblaciones: fundamentos teóricos y análisis de SNPs obtenidos con RAD-seq

Matías Mac Allister — Becario posdoctoral, CeBio, CITNOBA (UNNOBA-UNSADA-CONICET)
Diego Peralta — Investigador posdoctoral, Laboratorio de Evolución, Facultad de Ciencias, Universidad de la República

La genómica de poblaciones transformó nuestra capacidad para comprender la historia evolutiva y demográfica y analizar la conectividad genética y la estructura poblacional. Este taller conecta los fundamentos teóricos de la disciplina, apoyados en casos de estudio reales, con las herramientas bioinformáticas necesarias para un estudio genómico. En la parte práctica se trabajará con datos de secuenciación masiva (RAD-seq): desde el control de calidad y la limpieza de secuencias crudas, pasando por el llamado y filtrado de SNPs, hasta la ejecución e interpretación de análisis poblacionales.

Mañana

9:00 – 9:30

Acreditación y colgado de pósters

9:30 – 10:00

Apertura

10:00 – 10:45

Presentaciones orales de pósters

  1. 10:00

    Claudia Conte

    De lecturas no mapeadas a funciones bacterianas: caracterización transcriptómica de Serratia ureilytica en Anastrepha fraterculus

    Claudia Conte

    Instituto de Genética, Centro de Investigaciones en Ciencias Agronómicas y Veterinarias, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Hurlingham, Argentina

  2. 10:15

    Ana Sol Murzi

    Convergencia genética tejido-específica y gradientes de severidad clínica en la demencia por cuerpos de Lewy: un análisis interactómico neuroinmune

    Ana Sol Murzi

    Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Entre Ríos (FIUNER)

  3. 10:30

    Yael Nazar

    Un pipeline abierto de ensamblaje de novo para la vigilancia genómica de mammarenavirus

    Yael Nazar

    Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas "Dr. Julio I. Maiztegui" (INEVH-ANLIS), Pergamino, Buenos Aires, Argentina

10:45 – 11:15

Coffee break

11:15 – 12:10

Charlas invitadas

  1. 11:15

    Mariano Belaich

    Bioinformática como brújula, Ingeniería Genética como motor: descifrando el genoma de los baculovirus para potenciar sus biotecnologías

    Mariano Belaich

    Director General del LIGBCM, profesor asociado (UNQ) e investigador independiente (CONICET) — Laboratorio de Ingeniería Genética y Biología Celular y Molecular (LIGBCM), Instituto de Microbiología Básica y Aplicada (IMBA), Departamento de Ciencia y Tecnología (DCyT), Universidad Nacional de Quilmes (UNQ)

  2. 11:35

    Cintia Fabbri

    Vigilancia genómica integrada a la vigilancia laboratorial de dengue y otros arbovirus en Argentina: avances y desafíos

    Cintia Fabbri

    Jefa del Departamento de Investigación y Diagnóstico Referencial — Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas "Dr. J. I. Maiztegui" (INEVH-ANLIS)

  3. 11:55

    Preguntas a oradores/as

12:10 – 13:10

Gustavo Parisi

Charla estelar

Los transposones como fuente de diversidad conformacional en proteínas: regiones desordenadas y homología sin árboles filogenéticos

Gustavo Parisi

Profesor titular (UNQ) e investigador principal (CONICET) — Universidad Nacional de Quilmes (UNQ)

Resumen

Los transposones son segmentos cortos de ADN que se propagan por corte e inserción o copia e inserción en los genomas de la mayoría de los organismos. En los humanos, aproximadamente un 50% del genoma lo constituyen distintos tipos de transposones. En mi charla voy a mostrar resultados que indican que la inserción de transposones en regiones codificantes (mecanismo que se denomina "exonización") genera nuevas regiones desordenadas en las proteínas. Sin embargo, parece que este desorden tiene un tiempo de caducidad, ya que encontramos también que con el tiempo evolutivo, dichas regiones desordenadas se pueden "ordenar". Además, encontramos que la inserción repetida de transposones de la misma familia en genes distintos produce un nuevo tipo de módulos homólogos en proteínas que no lo son. A estos módulos, no descritos anteriormente en las estructuras proteicas, los denominamos "transpólogos", ya que proteínas no relacionadas filogenéticamente poseen segmentos casi idénticos debido a la homología de los transposones insertados. Ambos resultados abren una nueva línea de investigación sobre el origen de la diversidad conformacional y su relación con la función biológica debida a la inserción de transposones en proteínas.

13:10 – 14:00

Almuerzo

Tarde

14:00 – 15:30

Sesión de pósters

15:30 – 16:50

Charlas invitadas

  1. 15:30

    Agustina Pascual

    Bioinformática y transcriptómica para descifrar la biología de insectos de importancia agrícola

    Agustina Pascual

    Investigadora asistente (CONICET) y jefa de trabajos prácticos (UNNOBA) — Centro de BioInvestigaciones (CEBIO-UNNOBA), Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (CITNOBA-CONICET)

  2. 15:50

    María Laura Federico

    Breeding 4.0: el impacto de la bioinformática en el mejoramiento molecular de cultivos

    María Laura Federico

    Investigadora adjunta (CONICET) y profesora adjunta (UNNOBA) — CONICET-UNNOBA

  3. 16:10

    Ileana Tossolini

    Integrando genómica, epigenómica y transcriptómica para descubrir el impacto de los elementos transponibles en frutilla silvestre (Fragaria vesca)

    Ileana Tossolini

    Investigadora asistente (CONICET) y profesora titular (FI-UNER) — Instituto de Investigación y Desarrollo en Bioingeniería y Bioinformática (IBB, CONICET-UNER)

  4. 16:30

    Preguntas a oradores/as

16:50 – 17:15

Coffee break

17:15 – 18:00

Presentaciones orales de pósters

  1. 17:15

    Agustín Baricalla

    Activación de un programa transcriptómico HIF-like en células de melanoma con resistencia adquirida a vemurafenib

    Agustín Baricalla

    Facultad de Química, Bioquímica y Farmacia (FQByF), UNSL; IMIBIO-SL (UNSL – CONICET), San Luis, Argentina

  2. 17:30

    Aníbal Córdoba

    Recuperación de material genético del hospedador en microbiota de materia fecal humana: un acercamiento a la nutrigenómica

    Aníbal Córdoba

    Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Entre Ríos (FIUNER)

  3. 17:45

    Salomé Magallanes Elek

    Caracterización in silico de secuencias candidatas a SPL13 en Lotus japonicus mediante un enfoque bioinformático integrativo

    Salomé Magallanes Elek

    Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (UNNOBA)

18:00 – 19:00

Mesa redonda: Ciencia desde la trinchera

  1. Agustín Ormazábal

    Agustín Ormazábal

    Becario postdoctoral y docente universitario

    Universidad Nacional de Quilmes | CONICET

    Simulación computacional de biomoléculas

  2. Mercedes Didier Garnham

    Mercedes Didier Garnham

    Investigadora Posdoctoral

    IIB UNSAM

    Búsqueda de tratamientos para la Enfermedad del Chagas

  3. Gabriela Fernández

    Gabriela Fernández

    Profesora - Investigadora - Directora Maestría en Bioinformática y Biología de Sistemas (UNNOBA/UNQ)

    UNNOBA

    Genética de Poblaciones y Evolutiva / Genética de la Conservación

19:00 – 19:30

Palabras finales y premios

Resúmenes y pósters

Seguinos

Organizan

RSG Argentina Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (UNNOBA)