Aquí presentaremos algunos ejemplos abordados por nuestro grupo de investigación utilizando la técnica de Dinámica Molecular (MD), a nivel atómico y de grano grueso. En particular, discutiremos tres problemas. El primero será el estudio de la interacción de péptidos antimicrobianos con diferentes membranas lipídicas, buscando comprender su mecanismo de acción. El segundo tema se centrará en el estudio de las nanopartículas como nanotransportadores de fármacos y sus desafíos computacionales. Y en el tercero investigamos la autoagregación de la enzima aldo-ceto reductasa de T. cruzi.
11:20-11:40
Caracterización Genómica de cepas de Lactiplantibacillus plantarum con y sin actividad inmunomoduladora antiviral
11:40-12:00
Pipeline bioinformático para la caracterización del sitio de unión: identificación de aminoácidos clave en proteínas virales
En esta charla abordaremos las aplicaciones de las redes de similitud de secuencias de polipéptidos (sequence similarity networks, SSN) para estudiar la diversidad de secuencias dentro de superfamilias de proteínas, mostrando el análisis de conectividad de entornos (neighborhood connectivity, NC) como una herramienta simple y eficaz para hallar familias de proteínas dentro de conjuntos con un gran número de secuencias.
15:30-15:50
Biogénesis de microARNs en plantas, nuevo nivel de regulación desbloqueado: Procesamiento co-transcripcional de pri-miARNs favorecido por la formación de R-loops
15:50-16:10
Diferencias clave dentro del género Fructobacillus estudiado por genómica comparativa
16:10-16:30
¿Qué hacer cuando el docking no alcanza? La Quimioinformática al rescate en la búsqueda de Inhibidores de Acetilcolinesterasa
En la charla repasaremos las posibilidades que las tecnologías de secuenciación de nueva generación (en especial de lecturas largas) brindan para abordar nuevos desafíos de la genómica. Cómo hemos usado (y seguimos haciéndolo) estas tecnologías para realizar un seguimiento de las variantes circulantes de SARS-CoV-2, tanto como para secuenciar genomas de diferentes organismos. Cómo la bioinformática fue, es y seguirá siendo el pilar indispensable para la realización de este tipo de trabajos.
18:10-18:30
Caracterización genómica de aislados de Klebsiella pneumoniae ST25 hipermucoviscosos resistentes a Carbapenem del Noroeste argentino
18:30-18:50
Un Atlas subcelular de AKT como herramienta predictiva de sus roles fisiológico y patológico
18:50-19:10
Alteraciones transcripcionales y microARNs relevantes en la relación diabetes-cáncer pancreático
09:00-13:00 GMT-3 (Presencial en la FBQyF UNT)
En este taller aprenderás las principales funciones del lenguaje de programación R, te familiarizarás con la interfaz R Studio, y aprenderás de manera práctica a usar comandos básicos que podran ser aplicados en el análisis de un dataset biológico.
09:00-13:00 GMT-3 (Presencial en la FBQyF UNT)
Se describirán las tecnologías de secuenciación masiva de ADN y su aplicación a la ecología microbiana. Se discutirán herramientas bioinformáticas para analizar este tipo de datos, y se realizará una demostración práctica de un flujo de trabajo desde las lecturas del secuenciador hasta la obtención de la taxonomía de la comunidad microbiana de la muestra.
09:00-13:00 GMT-3 (Virtual)
En este workshop se abordarán herramientas de visualización de moléculas como también estrategias de simulación computacional orientadas a responder principalmente cómo se forman los complejos proteína-ligando (Docking molecular).
5th October - 12:00 - 13:00 (GMT-3)
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Mariano Elean, Leonardo Albarracín, Fernanda Raya Tonetti, Ramiro Ortiz Moyano, Stefania Dentice Maidana, Haruki Kitazawa, Julio Villena